Material for a Bayesian statistics workshop
R
(in Jags) :fr: Implémenter des analyses bayésiennes avec R
:uk: Videos are in French, but you may enable subtitles (or closed captions) by clicking on the :gear: icon in Youtube (beware though, R
is captioned as glass for some reasons :wine_glass:) :fr: Vidéos disponibles en français
R
is captioned as glass for some reasons) :fr: Vidéos disponibles en français
R
/ Matériel préparé avec R
:uk: Many slides are from a workshop we used to run a loooong time ago with Ruth King, Byron Morgan and Steve Brooks. I also re-used or adapted slides by Richard McElreath (16-20, 90-91, 166, 186), Kerrie Mengersen (16-20, 81), Francisco Rodriguez Sanchez (79-80; from the Stan manual), Jim Albert and Jingchen Hu (93-99), Tristan Marh (22), Jason Matthiopoulos (31-39, 196), a paper by Michael McCarthy and Pip Masters (71-73), Andrés Lopez-Sepulcre (126) and John Kruschke' book cover (61) :fr: Plusieurs diapos sont tirées d'un workshop que nous organisions il y a bien longtemps avec Ruth King, Byron Morgan et Steve Brooks. J'ai aussi utilisé et adapté des diapos de Richard McElreath (16-20, 90-91, 166, 186), Kerrie Mengersen (16-20, 81), Francisco Rodriguez Sanchez (79-80; from the Stan manual), Jim Albert and Jingchen Hu (93-99), Tristan Marh (22), Jason Matthiopoulos (31-39, 196), un papier de Michael McCarthy et Pip Masters (71-73), Andrés Lopez-Sepulcre (126) et la couverture du livre de John Kruschke (61).
:uk: The sources for the images are: James Kulich for slide 13, Matt Buck for slide 21, xkcd for slide 29 and Mike West for slide 194 :fr: Les sources des images sont : James Kulich pour la diapo 13, Matt Buck pour la diapo 21, xkcd pour la diapo 29 et Mike West pour la diapo 194
Code
green button at the top right of the page to create a copy of the repo within your own GitHub account (clone) :fr: Cliquez sur le bouton vert Code
en haut à droite et créer une copie du doossier dans votre compte GitHub (clone)Download ZIP
to download the repo to your computer :fr: Sinon, cliquez sur le même bouton vert et choisissez Download ZIP
pour télécharger le dossier compressé sur votre ordinateurR
or RStudio
installed :fr: Il vous faut R
ou RStudio
Jags
from sourceforge and install it :fr: Téléchargez Jags
depuis sourceforge et installez-le.R2jags
from R
or RStudio
:fr: Installez le package R2jags
depuis R
ou RStudio
:uk: If you spot a typo or an error, find a bug, or have trouble running the code, please file an issue or get back to me :fr: Si vous voyez une faute ou une erreur, ou un bug, n'hésitez pas à remplir un formulaire ou me contacter
:uk: This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License :fr: Ce travail est sous license Creative Commons Attribution 4.0 International License
Short term
Jags
, Stan
and Nimble
, there are other software options to fit models in the Bayesian framework that do not need coding. Check out the CRAN Task View: Bayesian Inference.ggplot2
; add short introduction to the Tidyverse
.Mid term
Jags
and Nimble
?Nimble
(resp. Stan
) and provide both the Jags
and Nimble
(resp. Stan
) codes. Translating Jags
code in Nimble
is easy. For now, check out training materials and examples.jagam
) and spatial analyses.Long term